桜も咲き始めた今年の3月。
「昨日の論文が書けないと思ったら・・・」は初めて論文を書く人向けの記事であった。
超絶偉そうだが、研究者に向けても書いてみようと思う。
ちなみに
・・不快に思う人はこれ以上読み進めないでください・・
別に読まなくても人生に影響はありません。
●●その1:実績がある人が、"論文が書けない"と思ったら・・・●●
休みましょう。以上。
研究者もそうだし、営業の仕事なんかでも言われるけれど、加点方式の仕事は終わりがない。1本論文がでても「さらにもう1本論文を書こう 」、「次はもっと良いジャーナルに・・」となる。
はたから見れば、「その業績で何を悩むんだ!?」と思うような人が、悩んで心身を崩すことがある。
ということで、実績がある人は「論文が書けない・・・」と思ったら、休むのが一番いいと思う。前の記事でも書いたが、近場でもいいので、全然知らないところに行ってみるのはお薦めです。
●●その2:"実績がない人"が、論文が書けないと思ったら・・・●●
i. 外部要因のせいにしないで論文書きましょう。
ii. データなくてもいいから論文書きましょう。
実績がない人は、論文を書く能力がないのではなく、論文を書くことを躊躇していることが多い。書かない理由をつけてためらっていることが多い。本当に多い。
「◯◯で忙しい」、「論文を書くための知識が足りない」、「データが足りない」、「英語が苦手」などである。
忙しくない社会人なんてそもそもそんなにいない。忙し宮内時を待っていたら、きっと職を失った時だと思う。
知識についても、人間は忘れる生き物である。せっかく論文などを読んでも、論文化していかないと、得た知識をどんどん忘れる。何も残らない。なので、論文を読んだらWordなどに書いてしまうこと、すなわち論文を書き始めてしまうことをお薦めしている。
また、データはいくら集めても足らない。そして、論文化してみると、論文に必須なデータと必須ではないデータがあることに気づく。
なので、論文化をしないでいくら実験をしても、無限に条件を変えて実験をすることになる。
データがなかったら、レビューやprotocolの論文なんかを書いてしまえば良いと思う。もちろんこれらを書くことで、論文を書く能力も鍛えられるし、実績にもなる。
ということで、論文が書けないと思ったら・・・””研究者編””というブログ記事を書いてみた。
ちなみにここでいう実績のあるなしは、自分の目的に達するために十分な実績があるかどうかである。
パーマネントのポジションを得るためには、良いジャーナルに多数論文を発表する必要がある。一方、ノーベル賞だったら、流行りの分野でいくらNatureを書いても取れない。あるグラントを獲得しようとしたら、すでに獲得している人たちと比較すれば、十分な実績かどうかわかる。一方、ビジネス展開を考えているのだったら、論文だけ書いても仕方がない。
ということで、実績のあるなしは人によるので、自分で自分の状況を考えて欲しいと思っている。いずれにせよ、論文を書くのは大変だけれど、毎日一歩ずつ進めれば、(レベルの違いはあるにせよ)だれでもできるものだと思っている。
公式リンク
2018年3月20日火曜日
2018年3月19日月曜日
論文が書けないと思ったら・・・
論文の書き方カテゴリーを作って、原著論文の書き方を記載している。
簡易版も掲載しているが、それでも論文を書くのが難しいと思う学生も多いと思う。
そのような場合、まず行うことは、
1. 結果をPowerpointで並べてみる。
結果の順番を入れ替えて、話をすっきりと通るようにする。
まずこれを行うと良い。「Powerpointではなく、Illustratorで!」とかいうのは上級者の話であり、いきなりそんなことをしようとすると1枚のスライド作るのに数日を費やしてしまう。
結果のPowerpointだったら、ゼミなどですでに作っていると思う。これらを並べ替えて、話が通るように組み替えてみ
る。実験を行った順番である必要はない。
その次にやることが、
2. 関連する論文を1、2文に要約して、Wordファイルに書いていく。その論文を引用リストに載せる。
こちらもゼミなどで文献紹介を行っていると思う。いろいろな質問をされるゼミに比べれば、読んだ論文を1、2文に要約するなんて簡単ではないだろうか?
うちの研究室の論文だったら、
シグマ因子SigEの転写活性が、クロロフィル合成酵素のサブユニットで直接制御されていることがわかった(Osanai et al. 2009)
シアノバクテリアのホスホエノールピルビン酸カルボキシラーゼは、フィードバック阻害を受けない特殊な酵素であることがわかった(Takeya et al. 2017)
ユーグレナは、窒素欠乏後に嫌気培養すると、コハク酸を細胞外に放出することがわかった(Tomita et al. 2017)
書いていき、あとでパズルのように並べ替えたり、削除や追加をすればよいのである。
論文書きはとても難しく思ってしまうが、一度挑戦してしまうと、それほどでもない。挑戦しないとすごく難しそうで、憂鬱になり、論文を書かない理由を見つけて、論文を書くことをやめてしまう。
ぜひ一歩踏み出してチャレンジすることを強くお薦めする。
簡易版も掲載しているが、それでも論文を書くのが難しいと思う学生も多いと思う。
そのような場合、まず行うことは、
1. 結果をPowerpointで並べてみる。
結果の順番を入れ替えて、話をすっきりと通るようにする。
まずこれを行うと良い。「Powerpointではなく、Illustratorで!」とかいうのは上級者の話であり、いきなりそんなことをしようとすると1枚のスライド作るのに数日を費やしてしまう。
結果のPowerpointだったら、ゼミなどですでに作っていると思う。これらを並べ替えて、話が通るように組み替えてみ
る。実験を行った順番である必要はない。
その次にやることが、
2. 関連する論文を1、2文に要約して、Wordファイルに書いていく。その論文を引用リストに載せる。
こちらもゼミなどで文献紹介を行っていると思う。いろいろな質問をされるゼミに比べれば、読んだ論文を1、2文に要約するなんて簡単ではないだろうか?
うちの研究室の論文だったら、
シグマ因子SigEの転写活性が、クロロフィル合成酵素のサブユニットで直接制御されていることがわかった(Osanai et al. 2009)
シアノバクテリアのホスホエノールピルビン酸カルボキシラーゼは、フィードバック阻害を受けない特殊な酵素であることがわかった(Takeya et al. 2017)
ユーグレナは、窒素欠乏後に嫌気培養すると、コハク酸を細胞外に放出することがわかった(Tomita et al. 2017)
書いていき、あとでパズルのように並べ替えたり、削除や追加をすればよいのである。
論文書きはとても難しく思ってしまうが、一度挑戦してしまうと、それほどでもない。挑戦しないとすごく難しそうで、憂鬱になり、論文を書かない理由を見つけて、論文を書くことをやめてしまう。
ぜひ一歩踏み出してチャレンジすることを強くお薦めする。
2018年3月18日日曜日
日本農芸化学会に参加
日本農芸化学会2018年度名古屋大会で発表を行った。
日本農芸化学会は、1924年に設置された学会であり、もうすぐ100周年ということになる。バイオテクノロジーに関連する研究者、技術者、学生が所属する学会で、会員数は1万人を越す巨大な学会である。
http://www.jsbba.or.jp/about/about_outline.html
場所は今回は名古屋開催で名城大学。とても綺麗なキャンパスであった。当日は、急に午後から冷えてきて、最低気温がなんと3℃という寒さであった。朝はとても暖かかったので、危うくコートを着ていかないところであった。
農芸化学会の年会に参加するのは、なんと15年ぶり。自分の分野だと、この時期には植物生理学会があったり、そもそも年度の切り替えの時期ということで、学会参加ができないことも多い。今回は植物生理学会をパスして、農芸化学会に参加した。最近自分の研究が、代謝工学や発酵、微生物生産などになってきたので、農芸化学会のほうがマッチする場合もある。
発表は8分間に質疑応答2分間。口頭発表のみというのが農芸化学会の特徴である。本当は自分ではなく、学生の方が発表をする良い機会であったのだが、3月は就活などの時期でもあるので、なかなか参加できなかった。ということで、今回は自分とテクスタSさんのみの参加であった。
開催は3日間あったが、自分が参加したのは2日間のみである。3月はいろいろ他にも仕事があるので、これくらいで終了。味噌煮込みうどんなんかも食べて、あっという間の学会終了でした(名古屋ご飯美味しかった)。
今後は農芸化学会はできれば毎年参加したいのだけれど、はたして・・・
日本農芸化学会は、1924年に設置された学会であり、もうすぐ100周年ということになる。バイオテクノロジーに関連する研究者、技術者、学生が所属する学会で、会員数は1万人を越す巨大な学会である。
http://www.jsbba.or.jp/about/about_outline.html
場所は今回は名古屋開催で名城大学。とても綺麗なキャンパスであった。当日は、急に午後から冷えてきて、最低気温がなんと3℃という寒さであった。朝はとても暖かかったので、危うくコートを着ていかないところであった。
農芸化学会の年会に参加するのは、なんと15年ぶり。自分の分野だと、この時期には植物生理学会があったり、そもそも年度の切り替えの時期ということで、学会参加ができないことも多い。今回は植物生理学会をパスして、農芸化学会に参加した。最近自分の研究が、代謝工学や発酵、微生物生産などになってきたので、農芸化学会のほうがマッチする場合もある。
発表は8分間に質疑応答2分間。口頭発表のみというのが農芸化学会の特徴である。本当は自分ではなく、学生の方が発表をする良い機会であったのだが、3月は就活などの時期でもあるので、なかなか参加できなかった。ということで、今回は自分とテクスタSさんのみの参加であった。
開催は3日間あったが、自分が参加したのは2日間のみである。3月はいろいろ他にも仕事があるので、これくらいで終了。味噌煮込みうどんなんかも食べて、あっという間の学会終了でした(名古屋ご飯美味しかった)。
今後は農芸化学会はできれば毎年参加したいのだけれど、はたして・・・
2018年3月17日土曜日
論文査読あるある・・・いや、ない。
久しぶりの論文査読あるあるシリーズ。
論文は、投稿すればすぐに掲載されるわけではない。査読(peer review)と言って、何人かの研究者によって審査され、追加実験などを行って、やっと採択されて、掲載されるのである。とても長い時間がかかる。
まず論文は、それぞれのジャーナルのエディター(editor)の元に行く。その後、エディターは2〜3人のレビューアー(reviewer、審査員)を選ぶ。レビューアーが論文を読んで様々なコメントをつけて判定し、最終的にエディターが判断するのである。
ということで、エディターが論文の審査には一番偉い人になる。
現在、あるジャーナルに論文を出しているのだけれど・・・・なんとエディターが途中で3回も代わり、ついに4人目である。
エディターというのは、その分野の著名な研究者がなるものであり、「例えば、誰々先生は◯◯ジャーナルのエディターです」というと、「おお!すごい」となるのである。
そのシステムをうまく利用したのがFrontiersというスイスの出版社が発行しているオンラインジャーナルシリーズである。うちもFrontiers in Microbiologyにたくさん論文を出している。
このFrontiersシリーズは通常通りのエディターもいるのだけれど、Research Topicsというもので、トピックスを提案して認められると、「誰でも一時的にエディターになれる」のである。このシステムで、「自分のジャーナル」と感じることができるので、すごく延びているジャーナルである。自分のFrontiers in MicrobiologyでResearch Topicsを一度作ったことがある。
ただ、やはりたまには弊害があって、それが今回である。
Frontiersシリーズに出したのだが、一人のエディターはアメリカのポスドクであった(ポスドクでもエディターになれる)。そしたら2ヶ月くらい放って置かれて、連絡しても何の返事もない。次もアメリカ在中のポスドクであり、対応してくれたかと思ったら、やはり放置になってしまった(3ヶ月経過)。
Frontiersオフィスが業を煮やして変えたらしく、今度は教授の方になったが、なぜか数日経って、また替わっていた。4人目のエディターである(3ヶ月半経過)。
途中でエディターが変わるというのは、長いリバイスをやっているとエディターの任期が終わってしまい、交代することはある。しかし、それでもせいぜい2人で、4人目とはいかに・・・である。
これのブログは「論文査読あるある」だけれど、さすがに初めてのケースである。
ただ、「想定外のいろんなことが起こる」という意味では、論文査読あるあるかもしれない。
本当にいろいろなことが起こるので、論文を通すにはメンタルの強さが必要不可欠である。
2018年3月16日金曜日
子供の卒園式終了とまさかの3つ目の・・
研究者にももちろん生活がある。世間一般からは、忘れられているようなのだけれど。。
子供(次男)が幼稚園を卒業。早いもので4月から小学生になる。
子育ては本当に大変なもので、「子供はかわいい!」だけではやっていけない。しかし、子供は奇跡のような幸せをくれたりもする。
乳児のころは全く目が離せないし、体力もないので風邪などをひいたときはとても心配ですぐに病院に駆けこまなければならない。まだまだ小さいけれど、子育ての最も忙しい時期は終わった気がする。
子供が生まれる前は、自分は仕事だけするような人間だと思っていた。しかし、子供の可愛さのため結構な時間を子供に費やしていると思う。研究者・大学教員なので比較的時間は自由になるので。仕事と子育ての両立はとても大変だけれど。
乳児期の子育てを振り返って思うことは、「もっと知っていれば楽だった」ということである。一人目の時はわからないので、余計なことをしたり、泣いている原因がわからなかったりしたのだけれど、そういう知識を二人目に活かすと、少し子育ての負担が減ったことを覚えている。
ただし、子育てをしてみなければ不可能といえば不可能な気がする。世の中には怪しい情報も溢れているので、知識だけだと間違った情報を信じてしまうかもしれない。
ということで、子育てのことについて紹介していくブログを作った。
大学教員が綴る37.5℃の育児体験談
https://ikuji99.blogspot.jp/
自分の子供の紹介ではなく、「例えば、子供用のお風呂は必要か?」などの体験談を紹介したいと思っている。自分の備忘録としても使う予定である。
子供(次男)が幼稚園を卒業。早いもので4月から小学生になる。
子育ては本当に大変なもので、「子供はかわいい!」だけではやっていけない。しかし、子供は奇跡のような幸せをくれたりもする。
乳児のころは全く目が離せないし、体力もないので風邪などをひいたときはとても心配ですぐに病院に駆けこまなければならない。まだまだ小さいけれど、子育ての最も忙しい時期は終わった気がする。
子供が生まれる前は、自分は仕事だけするような人間だと思っていた。しかし、子供の可愛さのため結構な時間を子供に費やしていると思う。研究者・大学教員なので比較的時間は自由になるので。仕事と子育ての両立はとても大変だけれど。
乳児期の子育てを振り返って思うことは、「もっと知っていれば楽だった」ということである。一人目の時はわからないので、余計なことをしたり、泣いている原因がわからなかったりしたのだけれど、そういう知識を二人目に活かすと、少し子育ての負担が減ったことを覚えている。
ただし、子育てをしてみなければ不可能といえば不可能な気がする。世の中には怪しい情報も溢れているので、知識だけだと間違った情報を信じてしまうかもしれない。
ということで、子育てのことについて紹介していくブログを作った。
大学教員が綴る37.5℃の育児体験談
https://ikuji99.blogspot.jp/
自分の子供の紹介ではなく、「例えば、子供用のお風呂は必要か?」などの体験談を紹介したいと思っている。自分の備忘録としても使う予定である。
いつもと違う場所に行こう。
学業でも研究でも社会人での仕事でも、やる気を継続するためのストレス解消法は必須であると思う。どんなに望んで入った大学、研究室、会社でも毎日続けれいれば嫌なことや辛いことがあったり、同じ仕事を続けることで飽きてしまったりすることがあると思う。
そういうときに、ただひたすら頑張ろう!だと、なかなか効率的に仕事を継続することができない。真面目な人ほど、学業・研究・仕事に対して、飽きてしまったり、辞めてしまいたくなることについて、罪悪感を覚えてしまいがちである。
しかし、そもそもどんな場所・場面でも、誰しもがそういう気分になるときがある。だから、そもそもそういう気分になることを想定して、その対策をしておいた方が良いのというのが、これまでの経験から得た回答である(言葉にすると当たり前すぎるけれど)。
やる気を継続したり、ストレスを解消するためにはいろいろな方法があると思う。
その一つが「いつもと違う場所に行くこと」であると思う。
自分はどちらかというと、過去には旅行に対して否定的なイメージを持っている人間であった。あまり旅行には積極的に行かなかったし、「なんか行ったら混んでいたり、移動したりして疲れるから、その辺で美味しいものでも食べていた方がいい」なんていう考えをする人間だった。
しかし、大学院からだんだんに学会やその他の研究・仕事でいろんな場所に行かざるを得なくなってきた。忙しい中移動すると、本当に疲れるのはその通りではあった。
ただし、やはり普段行かない場所に行くと、気分がすっきりすることがある。自然が多いところに行くのはもちろんのこと、都会であっても初めての場所に行くと、その後で気分が晴れることが多かった。
それに気づいてから、最近では飽きてきたり、効率が落ちてきたときには、定期的にいつもと違う場所に行くようにしている。
定期的に学会や研究会には行くのだけれど、そうでなくても行ったことのない街で適当なカフェなどに入ってみたりするだけでもとても気分が晴れる気がする。
カフェに限らず、全く知らない店などに入ってみたりするのも刺激的でリフレッシュできる。こういう癒しの効果ってどこから来るのか不思議なのだけれど、とにかく経験的に癒されることがわかってきた。なので、最近はうちの研究室のメンバーにも推奨している。
私の場合は学会や研究会に定期的に行くので、ほっておいても機会は来るが、そうでない人は定期的に近場でも行くといいと思う。
ただし、学会や研究会で疲れすぎないことにも配慮をしている。最初のうちは発表やディスカッションで全エネルギーを使い果たしてしまい、くたくたになってしまうことが多かった。最近でも、偉い先生たちと話すと素晴らしく勉強になるのだけれど、どうしても体に力が入っていて、終わった後に体が痛かったりする。うまく疲れないで学会や研究会を乗り切るのも大事であると考えている。
仕事を長く続けていく上で、やる気・モチベーションや心身の健康を保っていくことは最重要項目の一つである。気合を入れて頑張ろうという精神論ではなく、具体的な方法論で解決していきたいと考えている。
そういうときに、ただひたすら頑張ろう!だと、なかなか効率的に仕事を継続することができない。真面目な人ほど、学業・研究・仕事に対して、飽きてしまったり、辞めてしまいたくなることについて、罪悪感を覚えてしまいがちである。
しかし、そもそもどんな場所・場面でも、誰しもがそういう気分になるときがある。だから、そもそもそういう気分になることを想定して、その対策をしておいた方が良いのというのが、これまでの経験から得た回答である(言葉にすると当たり前すぎるけれど)。
やる気を継続したり、ストレスを解消するためにはいろいろな方法があると思う。
その一つが「いつもと違う場所に行くこと」であると思う。
自分はどちらかというと、過去には旅行に対して否定的なイメージを持っている人間であった。あまり旅行には積極的に行かなかったし、「なんか行ったら混んでいたり、移動したりして疲れるから、その辺で美味しいものでも食べていた方がいい」なんていう考えをする人間だった。
しかし、大学院からだんだんに学会やその他の研究・仕事でいろんな場所に行かざるを得なくなってきた。忙しい中移動すると、本当に疲れるのはその通りではあった。
ただし、やはり普段行かない場所に行くと、気分がすっきりすることがある。自然が多いところに行くのはもちろんのこと、都会であっても初めての場所に行くと、その後で気分が晴れることが多かった。
それに気づいてから、最近では飽きてきたり、効率が落ちてきたときには、定期的にいつもと違う場所に行くようにしている。
定期的に学会や研究会には行くのだけれど、そうでなくても行ったことのない街で適当なカフェなどに入ってみたりするだけでもとても気分が晴れる気がする。
カフェに限らず、全く知らない店などに入ってみたりするのも刺激的でリフレッシュできる。こういう癒しの効果ってどこから来るのか不思議なのだけれど、とにかく経験的に癒されることがわかってきた。なので、最近はうちの研究室のメンバーにも推奨している。
私の場合は学会や研究会に定期的に行くので、ほっておいても機会は来るが、そうでない人は定期的に近場でも行くといいと思う。
ただし、学会や研究会で疲れすぎないことにも配慮をしている。最初のうちは発表やディスカッションで全エネルギーを使い果たしてしまい、くたくたになってしまうことが多かった。最近でも、偉い先生たちと話すと素晴らしく勉強になるのだけれど、どうしても体に力が入っていて、終わった後に体が痛かったりする。うまく疲れないで学会や研究会を乗り切るのも大事であると考えている。
仕事を長く続けていく上で、やる気・モチベーションや心身の健康を保っていくことは最重要項目の一つである。気合を入れて頑張ろうという精神論ではなく、具体的な方法論で解決していきたいと考えている。
2018年3月15日木曜日
せとかの家系図
先日高級フルーツである「せとか」を頂いた。
せとかはこんな少し大きめのみかんであり、甘みが強く、ジューシーで、酸味が少ない。皮はうすいので、手で剥くことができる。種もない。・・・という理想的な食べ物である。
ネットで調べると、1個600円という値段であった。驚き。旬の季節が短く2月から3月までが美味しい季節とのことである。
瀬戸内で作られて、この品種が持つ「良香」にちなんで、せとかと名付けられたらしい。また、瀬戸内海の「せと」だけでなく、もとの育成地である長崎県口之津町から望む地名(早崎瀬戸)も由来の一つらしい。
日本の柑橘類というのはとても手が込んでいて、その進歩にはとても驚く。せとかも2001年に登録された新しいものである。
http://10-mikan.com/knowhow/mikan_no_kakeizu/
こちらのリンクを見ると、せとかは、「37号」と「マーコレット」という品種の交配から生まれたらしい。その「37号」は、「清見」と「アンコール」という品種の交配らしい。
「清見」と「ポンカン」を交配したものが最近有名な「デコポン」である。こちらはかなり全国区で有名な品種ではないだろうか。手で剥けて果肉が厚くて食べ応えがあり、酸味が少ないので、人気の品種である。
http://www.kyoto-u.ac.jp/ja/research/research_results/2016/documents/161201_1/01.pdf
こちらのリンクでは、ゲノム配列レベルで、柑橘類の系統を明らかにした論文がプレスリリースされている。せとかは載っていないが、例えば紀州みかんがいろいろな品種の親になっていることなどが遺伝子レベルで明らかになっている。おもしろいなあ・・・
ということで、頂き物の柑橘も調べてみると、交配の歴史から遺伝子までサイエンスになる。農学部にぴったりな話題なので、とりあえてみました。
せとかはこんな少し大きめのみかんであり、甘みが強く、ジューシーで、酸味が少ない。皮はうすいので、手で剥くことができる。種もない。・・・という理想的な食べ物である。
ネットで調べると、1個600円という値段であった。驚き。旬の季節が短く2月から3月までが美味しい季節とのことである。
瀬戸内で作られて、この品種が持つ「良香」にちなんで、せとかと名付けられたらしい。また、瀬戸内海の「せと」だけでなく、もとの育成地である長崎県口之津町から望む地名(早崎瀬戸)も由来の一つらしい。
日本の柑橘類というのはとても手が込んでいて、その進歩にはとても驚く。せとかも2001年に登録された新しいものである。
http://10-mikan.com/knowhow/mikan_no_kakeizu/
こちらのリンクを見ると、せとかは、「37号」と「マーコレット」という品種の交配から生まれたらしい。その「37号」は、「清見」と「アンコール」という品種の交配らしい。
「清見」と「ポンカン」を交配したものが最近有名な「デコポン」である。こちらはかなり全国区で有名な品種ではないだろうか。手で剥けて果肉が厚くて食べ応えがあり、酸味が少ないので、人気の品種である。
http://www.kyoto-u.ac.jp/ja/research/research_results/2016/documents/161201_1/01.pdf
こちらのリンクでは、ゲノム配列レベルで、柑橘類の系統を明らかにした論文がプレスリリースされている。せとかは載っていないが、例えば紀州みかんがいろいろな品種の親になっていることなどが遺伝子レベルで明らかになっている。おもしろいなあ・・・
ということで、頂き物の柑橘も調べてみると、交配の歴史から遺伝子までサイエンスになる。農学部にぴったりな話題なので、とりあえてみました。
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