2018年2月8日木曜日

ひさしぶりにICUを思い出してみる。no.3

ひさしぶりにICUを思い出してみるno.3である。

1年生はELPという英語の授業が大半を占め、ひたすら英語の勉強をさせられるのが国際基督教大学(ICU)教養学部であった(ICUには教養学部しかない)。受験勉強が終わり、大学に入学してさあ遊ぶぞ!なんて思ったら、全然遊べないじゃないか!というのは明治大学農学部だけではない(笑)

1年生は英語授業に加え、数学や生物学などの基礎科目の授業がある。また、特徴の1つが一般教育科目(General Education)で、通称ジェネードと呼ばれる科目である。

この一般教育科目(ジェネード)の特徴は、まずキリスト教概論に加え、自然科学、人文科学、社会科学などの授業を満遍なく取らなければならないことである。最終的に生物学を専攻した私だけれど、音楽の世界や西洋の劇場などなど全く異なる分野の授業を履修することになる。

また、その特徴が3年生の終わりまで一般教育科目があることである。普通は1年生で一般教育科目がだいたい終わりでより専門的な授業に入っていく。ところが、そこが教養学部(リベラルアーツ)の特徴で、一般教育科目の割合がものすごく多いのである。

これがリベラルアーツの良さであるのだけれど、どのくらい効果があるのかは正直わからない。そういった意味では、真にリベラルアーツの意味を理解していないのかもしれないが、少なくとも専門の授業が少ないので、大学院などへ進学するのに大変な思いをしたことは間違いない。

「キリスト教概論」の授業のディスカッションの際に、「もっと専門に偏って広く学んでもいいのではないか?」という意見を教授にぶつけたこともある。例えば生物学専攻ならば化学、物理、数学などいくらでも学ぶことがある。

これに対する返答は、「私はそうは思わない」というものであった。特に理由はなかった。ケースバイケースであるし、コントロールが取れるわけではないので、正解はわからないし、未だに答えは見えていない。教養学部とはそういうものであるとしかいいようがないかもしれない。

ちなみに我らが農芸化学科は、まさに専門分野を広く学んでいるのではないかと思う。化学・生物学を中心に、しかし、食品化学、微生物学、分析化学、環境化学、物理化学など少し特殊な分野が目白押しで勉強する範囲が広い。

要するに学生時代に私が主張していたことは、まさに農芸化学のように分野をせめてもう少し絞って広く学ぼうよというものである。そういった意味では、私は農芸化学に合うのかもしれない。。
(これは明大生田キャンパスの食堂の写真。ICUではない。)

では専門分野はどうするのかといえば、なんとパンフレットには専門的な研究は別の大学院でやってくださいと書いてあるのである(今のパンフレットは知らない)。リベラルアーツカレッジとは、徹底的に広く勉強し、勉強する方法を身に付けるところであって、研究をする場所ではないというスタンスである。

このため、専門分野の勉強は、だいたい他の大学の1年分位少ないというのが印象である。すなわち、よその理学部生物学科の2年生の内容を3年生でやっている。このため、大学院で外部に進学などをして外の人々と接すると、ICU生はまず壁にぶつかる。

自分たちは優秀だと思っていたのに、専門分野の勉強が1年分位少ない。そうすると専門的な知識が少なすぎて、なかなかその分野で成果を挙げることができない。そうすると、時として馬鹿にされたり、叱られたりするのである。

ここでだいたい専門分野から逃げ出そうとして、急に英語の試験を受けてみたり、留学を考えてみたり、ボランティアをしようという出すのもICU生あるあるだった。ようするに専門分野での負けを認めたくないのである。

この壁を突破できるかどうかで教養学部の真価が発揮されると思っている。専門分野で追いついた時には最初の幅の広さが役立つことだと思う(多分)。

このように、専門分野の授業が少なく、一般教養が多いのがICUの教養学部であり、卒業して他の大学の人と接するとかなりのギャップに驚くことになるのである。ここを突破できるかどうかで、教養学部の真価が問われると言っても過言ではない。

2018年2月7日水曜日

ひさしぶりにICUを思い出してみる。no.2

ICU(国際基督教大学)を思い出してみるno.2である。

国際基督教大学は、教養学部のみの大学である。私は当時あった理学科に所属していたのだけれど、3学年まで文系の授業もたくさんあり、純粋な理系ではなかった。

ICUで特徴的な授業がELP(English Learning Program)である。ようするに英語の授業である。なんと1年生の半分はこのELP、すなわち英語の授業である。色々と変わってはいるようだけれど、このELPは現在も教育の特色として残っているようである。
https://www.icu.ac.jp/about/interview_test/academics/m009/

英語をこのようにたくさん学ぶ反面、意外なこととしては、第2外国語を受講しにくかった面が挙げられる。これは、理系を専攻しようとする場合には学生実習が入るため、当然他の授業が取りにくくなる。実習のある日は、他の授業は全く取れないという理系あるあるである。現在は変わったらしいが、実習は単位が少ないということで、たくさん授業をたらなければいけない。こちらも理系あるあるである(明治大学農学部も同じ。。)。

ELPによって、1年生はかなりの人数が夏休みに1ヶ月半ほど語学留学に出かける。2年生では人数は少ないが、なんと数ヶ月間語学留学をする(現在の制度は変わっているかもしれない)。

私も1年生の夏休みに1ヶ月半ほどスコットランドのエディンバラ大学に語学留学に行った。最初の半分はホームステイで、残り半分は大学の寮に入った。

初めての長期での滞在だったので、苦労をしたのは覚えている。ホストファミリーは良い人たちだったのだが、なかなか英語がわからなくて、みんなが一緒に喋ると全然わからなかった記憶がある。

ICUは帰国子女や海外滞在経験がある人が多く、そういう経験がほとんどなかった私は結構苦労した。1回目の語学留学で全然わからずに悔しかったので、1年間お金を貯めて、2年生の夏休みには自分で申し込んだ語学留学に1ヶ月(アメリカ、ワシントンDC)に行った。懐かしい思い出である。

ELPの授業では、ライティングよりもディスカッションの時間が多かった気がする。基本的に授業は英語しか使わない。外国人の先生が1学期間クラスの担任のようにして授業を行っていた。1クラスは20名くらいであった。

このELPのクラスは「セクション」と呼ばれ、その中のメンバーを「セクションメイト」から「セクメ」と呼ばれていた。最初はこのメンバーのほとんどをファーストネームで呼び合う。よって、1年生の最初の頃の友人はファーストネームで呼んでいたりする。

しかし、2年生以降に知り合った人については、だんだん違和感を覚え、普通に苗字やニックネームになったりする。いろんな文化が混じり合い、よく分からないのがICUの中身だったりする(笑)。

ELPも宿題のようなものがたくさん出され、もちろん予習も要求される。分厚い黄色い教科書を渡されるのであるが、現在はどうなっているのだろうか。

現在の明治大学農学部もそうなのであるが、ICUも入学してから勉強ばかりで遊びで楽しかった記憶が全然ない(笑、いや泣)。しかし、振り返ってみると、例えば大学時代のアルバイト先での飲み会などは、楽しかったけれどあまり得るものがなかった。大学生的な楽しみは少なかったけれど、正直勉強しておいてよかったというのが現在の感想である(負け惜しみではない・・・)。

ということで、御多分に洩れず、大学に入って遊べるかと思ったらそれは全くの誤解だったというのがICUでの大学生活である。

no.3に続く。

2018年2月6日火曜日

ひさしぶりにICUを思い出してみる。no.1

そういえば久しく行っていないが、自分の出身大学である国際基督教大学について、語ってみようと思う。

国際基督教大学、International Christian Universityで通称ICU(アイシーユー)。国際基督教大学とは呼ばずにICUと呼ぶ場合が多い。地元三鷹市の人は「キリ大」と呼ぶらしいが、大学内部の人はほとんど使わない。

国際基督教大学

東京都三鷹市にあり、中央線の武蔵境駅が最寄りである。住宅街として人気の中央線である。新宿からわずか15~20分で、駅からは少し離れているが、結構都会に広大な敷地を占めている。少人数の大学にしては極めて自然豊かで贅沢な環境となっている。

最近ではICUといえば眞子様、佳子様のご入学である。このニュースでとても有名になったが、知らない人からすると「神父さんや牧師さんになるんですか?」と言われるのがICUあるあるである。宗教学の専攻もあると思うが、その道に進む人は少ないと思う。

学部は教養学部しかない。英語ではCollege of Liberal Arts。これでけである。最近はだいぶリベラルアーツという言葉も聞くようになってきた。一学年が500人くらいなので、小さい大学である。敷地は広くてとても気持ちがいい。

リベラルアーツとは何かと聞かれても、難しい。そんな解説はおこがましいが、簡単に言えば広い学問分野を横断的に学ぶことであると思う。もともとは理学科、人文学科などがあったが、それらを無くしたのもリベラルアーツの概念と矛盾するからかもしれない。

リベラルアーツに関するこんな記事もあった。
http://toyokeizai.net/articles/-/13769

日本の大学だと、1年時に外国語や基礎的な授業もあるが、2年生から専門的な授業に入ることが多い。一方、リベラルアーツカレッジの場合、卒業まで色々な分野を横断的に勉強することになる。

ICUのパンフレットにも書いてあったのだが(今は知らないが)、「専門的な研究は大学院で進めてください」と書いてある。これがリベラルアーツカレッジの特徴で、総合大学との違いである。大学生のうちは、幅広い分野を学び、専門は後にするという考えである。昨今はむしろ大学に職業訓練・実践的な教育を求める声も多い。このように広く学んで専門の勉強を後にすることについての是非については、議論があることだろう。人それぞれなので、結論を出すことはとても難しいと思う。

私が入学が1998年、卒業が2002年である。その当時は教養学部の中でも6つの学科(社会科学科、国際関係学科、人文科学科、教育学科、理学科、語学科)があり、3年生次に専攻を選ぶことになっていた。私の場合、入学時に理学科に選択し、3年時に生物学専攻を選んだのである。しかも、入学時には希望の学科に入れるとは限らず、点数が足りていても定員が埋まると他の学科になるという受験システムだった。

また、成績をきちんと取っていると、入学後に転科をすることも可能であった。3年生になってやっと生物学を専攻することが決まるというシステムで、それまでは物理や化学、情報科学が専門になる可能性もあった。

ICUは入学試験の方式が変わっている。今と異なるみたいだけれど、昔は国語的な長文読解、自然科学2科目、英語に加え、クイズみたいなものがあった(名前は忘れた・・・)。

例えば、
Q. すべての宇宙人が魚介類が好きだと仮定すると
A. 宇宙人以外は魚介類が好きではない
B. 宇宙人は肉が食べられない
C. 宇宙人は野菜を食べる可能性がある
・
・
という問題を延々と解いていくテストがあった。そもそもICUを受けようと思ったきっかけが、受験勉強で疲れていた高校生時に「変な問題がある!?」と思って興味を持ったためである。

受験対策も何もないので、普通に受験勉強をしていたのを覚えている。英語はとにかく長文であったことを覚えている。

今は調べたら入試科目が変わっていた。
https://www.icu.ac.jp/admissions/april/request/application04.html
総合教養という講義を聞いて答える形式のテストができたらしい。時代は流れるものであるが、昔のクイズがなくなったのは少し寂しい。あのテストが面白かったのだけれど・・・

no. 2につづく。

2018年2月5日月曜日

Cyanobacteria cultivation

BG-11 medium for cyanobacterial cultivation (for Synechocystis  and Synechococcus species)

1. Making Six stock solutions
Stock Sol. I
Citric acid 0.6 g 
Ferric ammonium citrate 0.6 g
Na
2EDTA 0.1 g /200 ml 

Stock Sol. II
NaNO3 30 g
K
2HPO4 0.78 g 
MgSO4・7H2O 1.5 g /1L 

Stock Sol. III
CaCl2・2H2O 3.8 g /200 ml 

Stock Sol. IV
Na2CO3 4 g/200 ml 

Stock Sol. V
H3BO3 2.86 g
MnCl
2・4H2O 1.81 g
ZnSO
4・7H2O 0.22 g
CuSO
4・5H2O 0.08 g
Na
2MoO4・2H2O 0.021 g
H
2SO4 50 uL 10% H2SO4 solutoin
Add MilliQ to 1L
mix them and then add cobalt powder
Co(NO
3)2・6H2O 0.0494 g 

1 M HEPES-KOH (pH7.8)
dissolve HEPES power and adjust the pH to 7.8 by KOH.

Stock Sol. I is sterilized by filtration and 1 M HEPES-KOH is sterilized by autoclave.
All stock solutions are stored at 4℃

2. Making BG-11 medium
Add 
50 mL Stock Sol. II, 
20 mL HEPES-KOH, 
2 mL Stock Sol. III, 
1 mL Stock Sol. IV
1 mL Stock Sol. V. to 900 mL MillQ 
and then add MilliQ to 1L.
After autoclave, add 2 mL Stock Sol. I to 1 L BG-11 medium. BG-11 medium is stored at room temperature.

3. Cultivation conditions
i. Light
White Light, 30~100 μmol photons m-2s-1, at 25~34℃.
(In our case, 50~70 μmol photons m-2s-1, 30℃)
ii. Air
Bubbling 1~3% CO2 to liquid BG-11 medium during cultivation
iii. Growth monitoring
The growth can be monitored by measuring OD730 or OD750.


4. Making freeze stocks
Concentrate 20~30 mL cells (OD730 = 1~2) to 500 μL by centrifugation (at Room temperature)
↓
Add 40 μL DMSO and mix thoroughly
↓
Store at -80℃

理化学研究所(RIKEN)とは?No.1 〜捏造スキャンダルの影響〜

そういえば、先日理化学研究所に久しぶりに行ってきた。先月は横浜、今月は和光市の方に行ってきた。

3年前の2015年4月に着任する前は、理化学研究所に在籍していた。現在も客員研究員として、横浜の元の研究室である平井チームと和光の沼田チームに所属している。ということで、カードを持っているので、理研には自由に出入りすることができる。。

理化学研究所、通称理研は日本最大の基礎科学の研究所である。英語だと、Institute of Physical and Chemical Researchだが、最近はRIKENとそのまま書いていることの方が多い。海外でもRIKENで通用するくらい、その筋では知られている。文部科学省所管の独立行政法人である。



英語の名前の通り、もともと物理と化学が強い研究所であるが、最近は生物学はもちろんあらゆる分野で日本のトップを走る研究所である。

本部は埼玉県の和光市にある(上の写真)。この間新元素を発見してニホニウムと名付けられたので、上記のような記念碑が入り口にあった。

この他にも横浜、神戸や播磨、名古屋や仙台、鶴岡にもある。非常に大きい総合研究拠点である。

全部で3500名以上の研究者・技術者・事務員などが働いでおり、年間1000億円くらいの予算を費やす研究所である。
http://www.riken.jp/about/facts/

ひと昔前までは、研究界隈では知らない人はいなかったが、物を売る場所ではないので、一般の人はあまり知らなかったかもしれない。

ところが数年前の神戸研究所での捏造スキャンダルによって、良くも悪くも誰でも知っているようになってしまった理化学研究所である。

何回かに渡って、理化学研究所を紹介したいと思う。

ちなみに、いきなり脱線感はあるが、当時の捏造スキャンダルの影響について。

その当時は理研の横浜研究所に在籍していた。問題は神戸研究所であったので、全然関係ないのであるが、同じ理化学研究所での出来事である。理研にいた最後の1、2年の話である。

最初は「すごい発見が理研から!」と沸き立った。分野はだいぶ異なるが、よその研究会の人と話しても、「素晴らしい若手が現れて、理研は素晴らしい!」とみんな手放しで喜んでいた。

ところが事件以降、論文の取り下げや再実験、世間への対応など、大騒ぎになったのはご存知の通り。電車に乗ると中吊り広告で「理化学研究所の机や椅子が◯◯万円!」なんてたくさん載っていて、こんなに有名になるとはと驚いたものである。

イメージが悪くなるだけならまあいいのであるけれど、実害がかなりあったことはあまり知られていないと思う。

当時私は、科学技術振興機構から競争的資金、いわゆる研究費を獲得していた。競争的資金といえば日本学術振興会の科研費が有名である。

このような予算をとると、直接研究に使える直接経費とともに、研究機関に間接経費という予算が入る。なぜ研究機関に?と思うかもしれないが、予算を使うには各種手続きが必要だし、機器や物品、人件費などを使うには膨大な事務手続きが必要である。これらを賄うための予算である。

一方で、獲得する研究費が大きくなってくると、事務手続きだけで間接経費を費やすのは難しい。一般的な研究機関では、一部の間接経費を研究者に戻し(ポケットに入るわけではない!)、研究者はこの間接経費で研究のための補助物品、例えば実験室の棚とか椅子とかプリンタとかを購入するのである。

他にも旅費や汎用的な試薬や機器、人件費にも使えることがある。柔軟に対応できる大事な予算なのである。

研究費で買えばいいじゃないか?と思うかもれないが、このような汎用的な什器、オフィス機器は研究費(直接経費)で買えないことがほとんどである。なので、間接経費で研究環境を整えることが極めて重要なのである。

じゃあ、どれくらいの間接経費が戻ってくるか?これが研究者と研究機関でしばしばバトルになるのである。

もっとも研究者に優しい研究所・大学では50%程度の間接経費を研究者に戻してくれる。

研究費をたくさん取っているような研究所・大学だと10%程度しか戻してくれないところもある。理研もあまり戻してはくれない。「研究費をたくさん取っているでしょ」という余裕の現れとも言えなくもない。

そして、例の事件の時であるが、間接経費の戻りが0%であった。もちろん、その事件のせいだけではないようだが、0%は驚きであった。

上記の通り、間接経費は椅子や机を買うだけではない。場合によっては試薬・機器、人件費に費やされる。

ということで、この煽りで研究費が削られ、年度更新がなくなったり、新規採用を取りやめた人もいるはずである。事実、私ももし間接経費が一部戻ってきたら、パートタイマーなどを雇うつもりであった。こうして、見えないところで人件費すなわち雇用への悪影響もあった。

のっけからややネガディブな話になってしまったが、理化学研究所の紹介をしていきたいと思う。

2018年2月4日日曜日

【重要】卒論・修論チェックリスト簡易版

卒論・修論の書き方の簡易版、チェックリストである。

□チェック1 文章を直されて、感情的になっていないか?
□チェック2 自分で推敲した後か?
□チェック3 序論:大きい話から小さい話の順番になっているか
□チェック4 序論:文末にすべて引用がついているか?総説ばかり引用していないか?
□チェック5 材料と方法:機器や試薬のメーカー名を書いているか。
□チェック6 材料と方法:いきなり略称になっていないか。
□チェック7 材料と方法:遠心分離の遠心力と時間を書いているか?
□チェック8 結果:図の量は適切であるか?図中の文字は小さすぎないか?
□チェック9 結果:図・表に載っているものはすべて文章で説明するのが基本

□チェック10 考察:結果の繰り返しになっていないか
□チェック11 参考文献:自分でフォーマットを統一する。後でまとめて書くは厳禁。


これらはあくまで一例で、他にも直すところはたくさんあると思う。

大事なことは、これらがきちんとできていないと、「内容をディスカッションするところまで到達せず、本人の成長にあまりつながらない」ことである。

ミスだけ直しても、あまり成長にはつながらない。しかし、ミスを直すだけで時間切れになってしまうことが多々あるので、ぜひこれらをチェックした上で、さらなる議論をしてもらいたいと思う。


いよいよ修論・卒論の提出、発表の期間になるので、今年の冬は結構寒いが、健康に留意して頑張ってもらいたいと思う。

2018年2月3日土曜日

【重要】卒論・修論チェックリストNo.3

卒論・修論のチェックリスト No.3は考察・議論(ディスカッション)から。

□チェック10 考察:結果の繰り返しになっていないか
これは論文の書き方などでも書いたが、最重要項目である。

考察に何を書いていいかわからない、勉強が足りないと、ひたすら結果を繰り返すことになる。そして、「次はこんな解析をしようと思っている」という次回の実験予定を書いて終わりになる。

自分の結果が、国内外の研究と比べてどうなのか、他の生物と比較してどうなのかなどは悩んでも苦しんでも調べなければ書くことはできない。

あまりにも調べることが膨大すぎて難しいのだが、1つ1つ検索して、「自分の結果の位置づけ」を書いていく。

このような考察をすれば、当然引用がたくさんつくはずである。もしあまり引用がないようだったら、あまり調べておらず、結果を繰り返していることが多い。

□チェック11 参考文献:自分でフォーマットを統一する。後でまとめて書くは厳禁。
こちらも多いが、参考文献をみるとフォーマットがバラバラだったりする。自分で、すべてチェックして直す。特に、

i. ファーストネームとファミリーネームの順番を統一
ii. .や,の後ろに半角スペース
iii. 年や号、ページなどの順番を統一
iv. ジャーナルの略称は自分で決めたはいけない。
v. 題名を書くときにイタリックや下付き・上付きなどの文字がきちんと書かれているか

などを自分で直す。ここでもそうだけれど、書くのは自分であって、「誰かに直してもらう」つもりだと、どんなに優秀な人が書いても見るに堪えない文章となる(教員も同じ)。

とりあえず、チェック項目は11個に。例によって、次の記事では簡易版を書きます。